盐酸胍已用于：
1、用作蛋白多糖提取缓冲液的组分
2、在ATDC5细胞系蛋白质分离过程中提取蛋白质
3、用作在结构分析中的化学添加剂，研究其有效吸收光谱
4、孵育设备芯片，以释放前列腺特异性抗原并再生适体
5、用作2,4-二硝基苯肼（DNPH）溶液组分，通过蛋白质羰基化研究检测蛋白质羰基
6、RNA分离，解离核蛋白并抑制RNase
7、强效离液剂，用于蛋白质的变性以及后续复性。该强效变性剂可溶解不溶性或变性的蛋白质，如包涵体。可用作使蛋白质或酶复性为活性形式的第一步骤。可能还需要脲和二硫苏糖醇 (DTT)。
生化/生理作用：
盐酸胍（GuHCl）是一个小型吸湿分子。它参与体内抑制热激蛋白104 (Hsp104) 腺苷三磷酸酶(ATPase)活性。它是多种酶和蛋白质的有效变性剂和灭活剂。GuHCl可以灭活氨酰酶和木瓜蛋白酶。它参与杂色鲍鱼体内的碱性磷酸酶去折叠和失活有关。较高浓度下的GuHCl可参与灭活病毒，如单纯疱疹病毒1(HSV-1)。
储存注意：
在储存过程中可能会结块。产品的质量似乎并没有受到影响，而且由自由流动和块状的盐酸胍制备的溶液似乎是一样的。
制备说明：
如需在水中制备8M的溶液，必须将溶液加热至35 °C后保持约30分钟。室温下盐酸胍在水中的最大溶解度约为6M。